Seksualno zlostavljanje polaznika Međubiskupijskog sjemeništa (gimnazije) na zagrebačkoj Šalati, prema njegovim tvrdnjama, počelo je ranih 2000-ih, kada je imao samo 16 godina, a trajalo je desetak godina, i nakon što je nastavio obrazovanje na Bogoslovnom sjemeništu u Đakovu na petogodišnjem filozofsko-teološkom studiju. Prema informacijama kojima raspolažemo, ispovjednici u sjemeništu žrtvi su, kad im se ispovjedio o zlostavljanju koje doživljava, govorili neka sve što prije zaboravi. Dijelom i zbog toga, žrtva je razvila osjećaj krivnje, a zlostavljač ga je “držao pod kontrolom” svojim autoritetom, novčanim darovima i omogućavajući mu pristup alkoholu, koji je mladić sve češće konzumirao.
Tek 2012., nakon što je otišao živjeti i studirati bogosloviju u Beč, počelo se doznavati za strahote koje je taj mladić prošao. Naime, jednom je u stanju rastresenosti i boli ispričao sve o seksualnom zlostavljanju koje je proživljavao desetak godina svom kolegi sa studija, koji je o tome pisao tadašnjem požeškom biskupu Antunu Škvorčeviću. Naime, žrtva je kao svog zlostavljača imenovala bivšeg biskupova bliskog suradnika.
Zanimljivo je da je navodni zlostavljač danas na visokoj poziciji u HBK-u zadužen za rad katoličkih škola.
Na kolegu zlostavljanog mladića, koji je slučaj prijavio biskupu Škvorčeviću, kasnije se vršio pritisak da promijeni iskaz te je sustavno proganjan, tvrde naši izvori.Škvorčević je, prema informacijama koje je dobio DNEVNIK.hr, tada čak i zadužio jednog svećenika da provede istragu, a iako je veća količina pisanih i digitalnih dokaznih materijala, korespodencije između žrtve i zlostavljača, ukazivala na istinitost tvrdnji žrtve i o njegovoj dubokoj ovisnosti o zlostavljaču, od istrage na kraju nije bilo ništa.
Zlostavljani mladić tada je čak i napisao pismo Škvorčeviću u kojem je negirao zlostavljanja, vjerojatno zbog srama ili straha od posljedica te ovisnosti o zlostavljaču, no kasnije je ponovno potvrdio da je zlostavljanja bilo.”Požeški biskup Ivo Martinović, po saznanju za predmetne navode, postupio je u skladu s važećim crkvenim i građanskim propisima te o njima obavijestio nadležna državna tijela i Nacionalni ured HBK-a za zaštitu maloljetnika i ranjivih osoba. Budući da su u tijeku postupanja nadležnih tijela, radi zaštite njihove provedbe i svih uključenih osoba Požeška biskupija u ovom trenutku ne može davati dodatne informacije niti komentirati pojedinosti slučaja”, odgovor je biskupije, iz kojeg proizlazi da je slučaj državnim vlastima prijavljen tek nakon Škvorčevićeva odlaska i dolaska Martinovića, koji je na čelu biskupije dvije godine.